Trong hơn 40 năm xây dựng và phát triển, Ngành Giáo dục và Đào tạo Thành phố Hồ Chí Minh đã nhiều lần được nhận các loại Huân chương. Cờ Thi đua, Bằng khen của Lãnh đạo các cấp để ghi nhận những nỗ lực và thành tích mà các thế hệ nhà giáo, cán bộ quản lý, học sinh, sinh viên Thành phố đã đạt được. Giáo dục và Đào tạo Thành phố Hồ Chí Minh đã vinh dự được tặng thưởng Huân chương Độc lập Hạng 3, Huân chương Lao động Hạng 1 và nhiều lần được nhận Bằng khen của Thủ tướng Chính phủ; nhận Cờ Thi đua Chính phủ vào các năm 2007 và 2013; nhiều lần nhận Cờ Thi đua, Bằng khen vì các thành tích xuất sắc trong thực hiện nhiệm vụ năm học của Bộ Giáo dục và Đào tạo và Ủy ban nhân dân Thành phố. Giáo dục Trung học thành phố với 264 trường THCS (gồm 9281 lớp với 385062 học sinh) và 190 trường THPT (gồm 4947 lớp với 192684 học sinh).
Kết quả Phổ cập giáo dục Trung học tiếp tục được đảm bảo. Năm 2002, hoàn thành phổ cập giáo dục Trung học cơ sở. Năm 2009, hoàn thành phổ cập giáo dục Trung học phổ thông (theo chuẩn của Thành phố).
Hoạt động nổi bật trong thời gian qua là sự phát triển của hoạt động học sinh nghiên cứu khoa học. Xuất phát từ các câu lạc bộ học thuật, đội – nhóm nghiên cứu khoa của các trường Trung học phổ thông, phong trào đã phát triển mạnh và được nhiều trường hưởng ứng mạnh mẽ. Từ Thành phố, hoạt động học sinh nghiên cứu khoa học đã được nhân rộng và Bộ GD&ĐT tổ chức các cuộc thi cấp Quốc gia trong những năm gần đây. Học sinh Thành phố cũng đã tham gia và đạt nhiều giải thưởng cao trong các kỳ thi cấp Quốc gia, khu vực và Quốc tế.
Mô hình trường tiên tiến, phù hợp với xu thế hội nhập khu vực và quốc tế được thí điểm thực hiện tại trường THPT Lê Quý Đôn, THPT Nguyễn Du, THPT Nguyễn Hiền là một trong những đột phá của Thành phố Hồ Chí Minh. Thành phố đã sớm phát hiện xu thế hội nhập là tất yếu. Mô hình này đã ngày càng khẳng định hiệu quả, được Lãnh đạo thành phố phê duyệt Tiêu chí và triển khai thực hiện đại trà trong thời gian tới.
Các trường THCS và trường THPT triển khai Đề án dạy và học các môn Toán, Khoa học và tiếng Anh tích hợp chương trình Anh và Việt Nam theo Quyết định 5659/QĐ-UBND ngày 20 tháng 11 năm 2014 của Ủy ban Nhân dân Thành phố Hồ Chí Minh về việc phê duyệt Đề án “Dạy và học các môn Toán, Khoa học và Tiếng Anh tích hợp chương trình Anh và Việt Nam”.